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L’analyse du profil d’expression génique est une partie importante du processus de développement des médicaments. Il s’agit d’un outil puissant qui peut être utilisé pour découvrir la « signature » moléculaire complexe d’une maladie et fournir des informations permettant de déterminer l’efficacité de nouveaux agents thérapeutiques.

En exploitant la puissance de NanoString et d’autres technologies basées sur la PCR, Labcorp peut fournir une variété de services d’analyse de l’expression génique (ADN et ARN) pour permettre aux chercheurs d’obtenir un instantané moléculaire du microenvironnement tumoral et de fournir des réponses qui peuvent aider les chercheurs à prendre des décisions lors de la découverte précoce d’un médicament en confirmant le mécanisme d’action attendu et l’interaction avec la cible d’un médicament. Ces services peuvent également être appliqués à des études de culture cellulaire pour la recherche de validation de concept avant de passer à des modèles in vivo .

Labcorp propose désormais la technologie ddPCR pour permettre la quantification des acides nucléiques avec ultrasensibilité et haute précision à l’aide du système QX200 de Bio-Rad. La ddPCR permet une quantification absolue de cibles moléculaires indétectables avec les techniques traditionnelles.

Récemment ajoutés au portefeuille de services de Labcorp, le système d’analyse nCounter® de NanoString et le GeoMx® Digital Spatial Profiler (DSP) peuvent être utilisés pour déterminer comment un médicament module l’expression des gènes et les voies de signalisation qui régulent la croissance tumorale.

Le NanoString nCounter® permet d’analyser simultanément jusqu’à 800 cibles d’ARN, d’ADN ou de protéines avec une sensibilité et une précision élevées. Le système utilise des « codes-barres » moléculaires et l’imagerie de molécules uniques pour quantifier des centaines de transcrits uniques dans un seul échantillon.

Parmi les autres avantages clés de l’utilisation du NanoString nCounter®, citons :

  • Un certain nombre de « panels prêts à l’emploi » pour l’oncologie (humaine et souris) sont disponibles, personnalisables pour inclure jusqu’à 55 cibles uniques supplémentaires
  • Optimisé pour les types d’échantillons difficiles (FFPE, tissus, lysats et biofluides)
  • Seules de faibles quantités d’échantillons précieux sont nécessaires
  • Précis et plus rapide que la qPCR (pas d’exigences d’amplification) et plus simple que le séquençage de nouvelle génération


Bien que NanoString nCounter® fournisse d’excellentes données quantitatives sur les niveaux d’expression des gènes ou des protéines à partir d’échantillons de tumeurs, le contexte spatial est essentiel pour obtenir des informations plus approfondies sur la biologie tissulaire. NanoString GeoMx® DSP est la solution de biologie spatiale et peut être utilisé pour mieux comprendre la tumeur et les interactions complexes au sein du microenvironnement tumoral.

En plus d’être utilisé comme service in vitro autonome pour le criblage de l’expression génétique à l’aide de modèles cellulaires , NanoString peut également être utilisé dans un cadre ex vivo pour analyser le mécanisme d’action des médicaments dans des modèles animaux in vivo , offrant ainsi la possibilité de cribler plusieurs traitements pour identifier des composés principaux prometteurs .  

Nous utilisons un système de PCR en temps réel StepOnePlus™ qui peut lire quatre couleurs différentes dans une plaque de 96 puits et prend en charge des tests tels que le génotypage SNP, l’analyse de l’expression génique, l’expression de microARN, l’analyse de translocation et la détection de gènes. Nos spécialistes en PCR peuvent vous aider à déterminer l’expression de gènes spécifiques dans des cellules cultivées, des tissus frais ou des tissus congelés. Que vous ayez besoin de mesurer l’expression de gènes dans différentes lignées cellulaires, souches de souris, tissus ou tumeurs, ou de surveiller l’expression de différents gènes avec différents traitements, nos spécialistes de la PCR peuvent vous aider à concevoir une étude qui vous convient.

Le profilage de l’expression génique est la mesure de l’activité (l’expression) de milliers de gènes à la fois pour créer une image globale de la fonction cellulaire. L’ARN est séquencé à l’aide d’un séquençage de nouvelle génération, quantifié et aligné sur des milliers de séquences d’ARN connues provenant de gènes spécifiques. Ces profils peuvent, par exemple, distinguer les cellules qui se divisent activement, montrer comment les cellules réagissent à un traitement particulier ou déterminer quels gènes sont exprimés de manière différentielle dans différentes lignées cellulaires, souches de souris, tissus ou tumeurs. Labcorp collabore avec un laboratoire partenaire spécialisé dans le séquençage de l’ARN. Une fois que nous obtenons les informations de séquençage, nous disposons du logiciel pour quantifier, aligner et analyser les données. Nous pouvons comparer l’expression de gènes uniques, d’ensembles de gènes apparentés, de groupes de gènes spécifiques à une voie ou à un processus, et de génomes entiers entre des échantillons et afficher les résultats comparatifs sous forme de graphiques et de figures simples.

Accédez à une offre personnalisée pour répondre à vos besoins en matière d’expression génique

Chez Labcorp, nous combinons des technologies de pointe avec une offre de services sur mesure pour répondre à vos exigences en matière d’expression génique. Notre équipe hautement spécialisée possède une vaste connaissance et une grande expérience dans le développement, l’optimisation et la validation des lectures de l’expression génique tout au long du processus de découverte de médicaments. Nous travaillons en étroite collaboration avec vous pour concevoir un flux de travail sur mesure afin de générer une multitude de données pour vous aider à découvrir le mécanisme d’action de vos composés et les voies de signalisation et/ou les gènes en aval qui sont régulés dans le contexte de la croissance tumorale. Nous sommes fiers d’avoir un vaste portefeuille de modèles animaux/tumoraux pour nous assurer que nous pouvons fournir à nos clients le modèle le « mieux adapté » à leur projet. Contactez-nous dès aujourd’hui pour discuter de vos besoins en matière d’étude et de la façon dont nos services d’analyse de l’expression génétique peuvent apporter de nouvelles perspectives à vos projets de recherche. 

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MISE EN LUMIÈRE

Le panel nCounter® IO 360™ et la cytométrie en flux combinent le profil transcriptomique et les profils immunophénotypiques des sous-ensembles immunitaires pour offrir une analyse complète de l’immunothérapie des tumeurs

Le profilage transcriptomique peut être utilisé pour examiner l’interaction entre le microenvironnement tumoral (TME) et le système immunitaire et constitue un outil puissant pour étudier l’action mécaniste des immunothérapies. Dans ce Tech Spotlight, nous démontrons comment l’expression génique mesurée dans les tumeurs solides à l’aide du panel nCounter® PanCancer IO 360™ (NanoString Technologies) peut être combinée à la cytométrie en flux pour fournir une évaluation complète des effets de l’immunothérapie sur la réponse immunitaire anti-tumorale.

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